Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms