Protein–RNA interactions for Protein: P05156

CFI, Complement factor I, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFIP05156 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFIP05156 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFIP05156 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CFIP05156 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CFIP05156 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CFIP05156 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CFIP05156 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CFIP05156 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFIP05156 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CFIP05156 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFIP05156 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFIP05156 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CFIP05156 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFIP05156 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFIP05156 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CFIP05156 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CFIP05156 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CFIP05156 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CFIP05156 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CFIP05156 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CFIP05156 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CFIP05156 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CFIP05156 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CFIP05156 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CFIP05156 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CFIP05156 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CFIP05156 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CFIP05156 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFIP05156 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFIP05156 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFIP05156 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFIP05156 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CFIP05156 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFIP05156 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CFIP05156 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CFIP05156 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFIP05156 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFIP05156 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFIP05156 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CFIP05156 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFIP05156 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFIP05156 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFIP05156 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CFIP05156 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFIP05156 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CFIP05156 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFIP05156 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CFIP05156 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFIP05156 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFIP05156 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CFIP05156 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFIP05156 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFIP05156 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CFIP05156 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFIP05156 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFIP05156 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CFIP05156 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFIP05156 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CFIP05156 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CFIP05156 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CFIP05156 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CFIP05156 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFIP05156 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CFIP05156 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CFIP05156 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CFIP05156 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CFIP05156 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFIP05156 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CFIP05156 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CFIP05156 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CFIP05156 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CFIP05156 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFIP05156 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CFIP05156 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CFIP05156 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFIP05156 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CFIP05156 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CFIP05156 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CFIP05156 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CFIP05156 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CFIP05156 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CFIP05156 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CFIP05156 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFIP05156 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CFIP05156 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CFIP05156 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFIP05156 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CFIP05156 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CFIP05156 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CFIP05156 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFIP05156 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFIP05156 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CFIP05156 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CFIP05156 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CFIP05156 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CFIP05156 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CFIP05156 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CFIP05156 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFIP05156 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CFIP05156 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms