Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APODP05090 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APODP05090 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APODP05090 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APODP05090 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APODP05090 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APODP05090 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APODP05090 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APODP05090 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APODP05090 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APODP05090 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APODP05090 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APODP05090 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APODP05090 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APODP05090 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APODP05090 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APODP05090 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APODP05090 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APODP05090 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APODP05090 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APODP05090 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APODP05090 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APODP05090 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APODP05090 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APODP05090 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APODP05090 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APODP05090 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APODP05090 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APODP05090 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APODP05090 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APODP05090 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APODP05090 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APODP05090 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APODP05090 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APODP05090 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APODP05090 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APODP05090 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APODP05090 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APODP05090 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APODP05090 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
APODP05090 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APODP05090 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APODP05090 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APODP05090 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APODP05090 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APODP05090 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APODP05090 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APODP05090 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APODP05090 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APODP05090 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APODP05090 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APODP05090 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APODP05090 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APODP05090 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APODP05090 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APODP05090 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APODP05090 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APODP05090 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
APODP05090 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APODP05090 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APODP05090 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APODP05090 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APODP05090 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
APODP05090 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APODP05090 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APODP05090 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APODP05090 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
APODP05090 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APODP05090 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APODP05090 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APODP05090 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APODP05090 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APODP05090 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APODP05090 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APODP05090 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APODP05090 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APODP05090 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APODP05090 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APODP05090 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APODP05090 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APODP05090 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APODP05090 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APODP05090 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APODP05090 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APODP05090 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APODP05090 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APODP05090 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APODP05090 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APODP05090 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APODP05090 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APODP05090 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APODP05090 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APODP05090 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APODP05090 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APODP05090 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APODP05090 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APODP05090 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APODP05090 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APODP05090 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APODP05090 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms