Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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