Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX6O95503 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX6O95503 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX6O95503 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX6O95503 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX6O95503 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX6O95503 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX6O95503 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX6O95503 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX6O95503 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX6O95503 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CBX6O95503 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CBX6O95503 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CBX6O95503 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CBX6O95503 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CBX6O95503 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CBX6O95503 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CBX6O95503 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CBX6O95503 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CBX6O95503 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CBX6O95503 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX6O95503 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX6O95503 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX6O95503 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX6O95503 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX6O95503 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX6O95503 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX6O95503 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX6O95503 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX6O95503 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX6O95503 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX6O95503 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX6O95503 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX6O95503 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX6O95503 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX6O95503 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX6O95503 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX6O95503 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX6O95503 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX6O95503 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX6O95503 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX6O95503 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX6O95503 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX6O95503 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX6O95503 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX6O95503 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX6O95503 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX6O95503 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX6O95503 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX6O95503 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX6O95503 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX6O95503 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX6O95503 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX6O95503 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX6O95503 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX6O95503 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX6O95503 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX6O95503 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX6O95503 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX6O95503 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX6O95503 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX6O95503 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX6O95503 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX6O95503 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX6O95503 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX6O95503 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX6O95503 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX6O95503 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX6O95503 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX6O95503 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX6O95503 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX6O95503 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX6O95503 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX6O95503 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX6O95503 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX6O95503 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX6O95503 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX6O95503 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX6O95503 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX6O95503 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX6O95503 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX6O95503 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX6O95503 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX6O95503 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX6O95503 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX6O95503 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX6O95503 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX6O95503 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX6O95503 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX6O95503 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX6O95503 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX6O95503 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX6O95503 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX6O95503 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX6O95503 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX6O95503 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX6O95503 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX6O95503 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX6O95503 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX6O95503 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms