Protein–RNA interactions for Protein: O75712

GJB3, Gap junction beta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB3O75712 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJB3O75712 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJB3O75712 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJB3O75712 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJB3O75712 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJB3O75712 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJB3O75712 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GJB3O75712 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJB3O75712 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJB3O75712 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJB3O75712 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJB3O75712 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJB3O75712 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJB3O75712 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJB3O75712 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJB3O75712 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJB3O75712 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJB3O75712 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJB3O75712 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJB3O75712 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GJB3O75712 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJB3O75712 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GJB3O75712 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJB3O75712 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJB3O75712 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJB3O75712 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJB3O75712 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJB3O75712 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJB3O75712 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GJB3O75712 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GJB3O75712 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJB3O75712 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GJB3O75712 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GJB3O75712 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJB3O75712 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJB3O75712 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJB3O75712 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJB3O75712 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GJB3O75712 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GJB3O75712 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GJB3O75712 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GJB3O75712 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GJB3O75712 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GJB3O75712 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GJB3O75712 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GJB3O75712 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GJB3O75712 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GJB3O75712 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GJB3O75712 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GJB3O75712 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB3O75712 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB3O75712 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB3O75712 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB3O75712 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB3O75712 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB3O75712 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB3O75712 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB3O75712 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB3O75712 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB3O75712 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB3O75712 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB3O75712 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB3O75712 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB3O75712 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB3O75712 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB3O75712 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB3O75712 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB3O75712 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB3O75712 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB3O75712 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB3O75712 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB3O75712 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB3O75712 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB3O75712 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB3O75712 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB3O75712 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB3O75712 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB3O75712 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB3O75712 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB3O75712 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB3O75712 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB3O75712 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB3O75712 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB3O75712 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB3O75712 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB3O75712 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB3O75712 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB3O75712 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB3O75712 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB3O75712 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB3O75712 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB3O75712 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB3O75712 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB3O75712 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB3O75712 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB3O75712 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB3O75712 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB3O75712 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB3O75712 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJB3O75712 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms