Protein–RNA interactions for Protein: O43602

DCX, Neuronal migration protein doublecortin, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCXO43602 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCXO43602 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCXO43602 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCXO43602 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCXO43602 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCXO43602 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCXO43602 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCXO43602 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DCXO43602 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCXO43602 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCXO43602 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCXO43602 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCXO43602 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCXO43602 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCXO43602 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCXO43602 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCXO43602 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCXO43602 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCXO43602 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCXO43602 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCXO43602 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCXO43602 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCXO43602 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCXO43602 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DCXO43602 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCXO43602 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCXO43602 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCXO43602 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCXO43602 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCXO43602 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCXO43602 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCXO43602 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCXO43602 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCXO43602 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCXO43602 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCXO43602 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DCXO43602 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCXO43602 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DCXO43602 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCXO43602 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCXO43602 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCXO43602 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCXO43602 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCXO43602 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCXO43602 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCXO43602 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCXO43602 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCXO43602 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DCXO43602 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCXO43602 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCXO43602 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCXO43602 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DCXO43602 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCXO43602 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCXO43602 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCXO43602 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCXO43602 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCXO43602 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCXO43602 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCXO43602 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCXO43602 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCXO43602 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCXO43602 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCXO43602 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCXO43602 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCXO43602 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DCXO43602 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCXO43602 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCXO43602 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCXO43602 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCXO43602 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCXO43602 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCXO43602 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCXO43602 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCXO43602 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCXO43602 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCXO43602 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCXO43602 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCXO43602 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DCXO43602 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCXO43602 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCXO43602 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCXO43602 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCXO43602 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DCXO43602 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCXO43602 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCXO43602 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCXO43602 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCXO43602 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DCXO43602 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCXO43602 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCXO43602 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCXO43602 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCXO43602 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCXO43602 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCXO43602 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCXO43602 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCXO43602 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCXO43602 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCXO43602 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms