Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DENRO43583 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DENRO43583 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DENRO43583 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DENRO43583 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DENRO43583 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DENRO43583 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DENRO43583 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DENRO43583 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DENRO43583 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DENRO43583 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DENRO43583 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DENRO43583 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
DENRO43583 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
DENRO43583 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DENRO43583 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DENRO43583 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DENRO43583 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
DENRO43583 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DENRO43583 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
DENRO43583 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DENRO43583 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DENRO43583 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
DENRO43583 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DENRO43583 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DENRO43583 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
DENRO43583 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DENRO43583 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DENRO43583 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DENRO43583 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DENRO43583 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DENRO43583 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DENRO43583 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DENRO43583 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
DENRO43583 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DENRO43583 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DENRO43583 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DENRO43583 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DENRO43583 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DENRO43583 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DENRO43583 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DENRO43583 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DENRO43583 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DENRO43583 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DENRO43583 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DENRO43583 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DENRO43583 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DENRO43583 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DENRO43583 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DENRO43583 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DENRO43583 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DENRO43583 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
DENRO43583 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DENRO43583 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DENRO43583 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DENRO43583 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DENRO43583 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DENRO43583 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DENRO43583 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DENRO43583 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DENRO43583 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DENRO43583 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DENRO43583 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DENRO43583 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DENRO43583 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DENRO43583 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DENRO43583 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DENRO43583 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DENRO43583 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DENRO43583 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DENRO43583 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DENRO43583 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DENRO43583 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DENRO43583 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DENRO43583 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DENRO43583 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DENRO43583 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DENRO43583 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DENRO43583 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DENRO43583 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
DENRO43583 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
DENRO43583 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DENRO43583 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DENRO43583 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DENRO43583 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DENRO43583 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DENRO43583 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DENRO43583 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DENRO43583 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DENRO43583 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DENRO43583 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DENRO43583 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DENRO43583 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DENRO43583 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DENRO43583 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DENRO43583 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DENRO43583 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DENRO43583 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DENRO43583 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DENRO43583 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.9 ms