Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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