Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
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