Protein–RNA interactions for Protein: D6REC4

CFAP99, Cilia- and flagella-associated protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP99D6REC4 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 AL031670.1-201ENST00000619343 669 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP99D6REC4 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms