Protein–RNA interactions for Protein: A6NN92

GJE1, Gap junction epsilon-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJE1A6NN92 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GJE1A6NN92 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GJE1A6NN92 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GJE1A6NN92 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GJE1A6NN92 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GJE1A6NN92 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GJE1A6NN92 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GJE1A6NN92 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GJE1A6NN92 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GJE1A6NN92 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GJE1A6NN92 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GJE1A6NN92 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GJE1A6NN92 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GJE1A6NN92 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GJE1A6NN92 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GJE1A6NN92 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GJE1A6NN92 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GJE1A6NN92 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GJE1A6NN92 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GJE1A6NN92 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GJE1A6NN92 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GJE1A6NN92 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GJE1A6NN92 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GJE1A6NN92 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GJE1A6NN92 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GJE1A6NN92 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GJE1A6NN92 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GJE1A6NN92 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GJE1A6NN92 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GJE1A6NN92 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GJE1A6NN92 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GJE1A6NN92 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GJE1A6NN92 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GJE1A6NN92 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GJE1A6NN92 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GJE1A6NN92 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
GJE1A6NN92 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
GJE1A6NN92 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GJE1A6NN92 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GJE1A6NN92 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GJE1A6NN92 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
GJE1A6NN92 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GJE1A6NN92 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GJE1A6NN92 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GJE1A6NN92 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GJE1A6NN92 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GJE1A6NN92 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GJE1A6NN92 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GJE1A6NN92 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GJE1A6NN92 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
GJE1A6NN92 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GJE1A6NN92 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GJE1A6NN92 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GJE1A6NN92 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GJE1A6NN92 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GJE1A6NN92 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GJE1A6NN92 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GJE1A6NN92 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
GJE1A6NN92 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
GJE1A6NN92 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
GJE1A6NN92 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GJE1A6NN92 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GJE1A6NN92 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GJE1A6NN92 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GJE1A6NN92 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GJE1A6NN92 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GJE1A6NN92 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GJE1A6NN92 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GJE1A6NN92 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GJE1A6NN92 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GJE1A6NN92 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GJE1A6NN92 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GJE1A6NN92 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GJE1A6NN92 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GJE1A6NN92 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GJE1A6NN92 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GJE1A6NN92 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GJE1A6NN92 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GJE1A6NN92 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GJE1A6NN92 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GJE1A6NN92 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GJE1A6NN92 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GJE1A6NN92 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GJE1A6NN92 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GJE1A6NN92 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GJE1A6NN92 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GJE1A6NN92 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GJE1A6NN92 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GJE1A6NN92 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GJE1A6NN92 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GJE1A6NN92 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GJE1A6NN92 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GJE1A6NN92 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GJE1A6NN92 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GJE1A6NN92 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GJE1A6NN92 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GJE1A6NN92 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GJE1A6NN92 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GJE1A6NN92 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GJE1A6NN92 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms