Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms