Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms