Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms