Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms