Protein–RNA interactions for Protein: V9GYY9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 64 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYY9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
V9GYY9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
V9GYY9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
V9GYY9 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
V9GYY9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
V9GYY9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
V9GYY9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
V9GYY9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
V9GYY9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
V9GYY9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
V9GYY9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
V9GYY9 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
V9GYY9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
V9GYY9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
V9GYY9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
V9GYY9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
V9GYY9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
V9GYY9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
V9GYY9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
V9GYY9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
V9GYY9 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
V9GYY9 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
V9GYY9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
V9GYY9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
V9GYY9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
V9GYY9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
V9GYY9 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
V9GYY9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
V9GYY9 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
V9GYY9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
V9GYY9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
V9GYY9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
V9GYY9 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
V9GYY9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
V9GYY9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
V9GYY9 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
V9GYY9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
V9GYY9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
V9GYY9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
V9GYY9 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
V9GYY9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
V9GYY9 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
V9GYY9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
V9GYY9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
V9GYY9 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
V9GYY9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
V9GYY9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
V9GYY9 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
V9GYY9 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
V9GYY9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
V9GYY9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
V9GYY9 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
V9GYY9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
V9GYY9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
V9GYY9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
V9GYY9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
V9GYY9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
V9GYY9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
V9GYY9 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
V9GYY9 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
V9GYY9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
V9GYY9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
V9GYY9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
V9GYY9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
V9GYY9 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
V9GYY9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
V9GYY9 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
V9GYY9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
V9GYY9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
V9GYY9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
V9GYY9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
V9GYY9 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
V9GYY9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
V9GYY9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
V9GYY9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
V9GYY9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
V9GYY9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
V9GYY9 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
V9GYY9 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
V9GYY9 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
V9GYY9 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
V9GYY9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
V9GYY9 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
V9GYY9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
V9GYY9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
V9GYY9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
V9GYY9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
V9GYY9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
V9GYY9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
V9GYY9 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
V9GYY9 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
V9GYY9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
V9GYY9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
V9GYY9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
V9GYY9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
V9GYY9 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
V9GYY9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
V9GYY9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
V9GYY9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
V9GYY9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms