Protein–RNA interactions for Protein: U3KQV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQV3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KQV3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KQV3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KQV3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KQV3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KQV3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KQV3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KQV3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
U3KQV3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
U3KQV3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
U3KQV3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
U3KQV3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
U3KQV3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
U3KQV3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
U3KQV3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
U3KQV3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
U3KQV3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
U3KQV3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
U3KQV3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
U3KQV3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
U3KQV3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
U3KQV3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
U3KQV3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
U3KQV3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
U3KQV3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
U3KQV3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
U3KQV3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
U3KQV3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
U3KQV3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
U3KQV3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
U3KQV3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
U3KQV3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
U3KQV3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
U3KQV3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
U3KQV3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
U3KQV3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
U3KQV3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
U3KQV3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
U3KQV3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
U3KQV3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
U3KQV3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
U3KQV3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
U3KQV3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
U3KQV3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
U3KQV3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
U3KQV3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
U3KQV3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
U3KQV3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
U3KQV3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
U3KQV3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
U3KQV3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
U3KQV3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
U3KQV3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
U3KQV3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
U3KQV3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
U3KQV3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
U3KQV3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
U3KQV3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
U3KQV3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
U3KQV3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
U3KQV3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
U3KQV3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
U3KQV3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
U3KQV3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
U3KQV3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
U3KQV3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
U3KQV3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
U3KQV3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
U3KQV3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
U3KQV3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
U3KQV3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
U3KQV3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
U3KQV3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
U3KQV3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
U3KQV3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
U3KQV3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
U3KQV3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
U3KQV3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
U3KQV3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
U3KQV3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
U3KQV3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
U3KQV3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
U3KQV3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
U3KQV3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
U3KQV3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
U3KQV3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
U3KQV3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
U3KQV3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
U3KQV3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
U3KQV3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
U3KQV3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
U3KQV3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
U3KQV3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
U3KQV3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
U3KQV3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
U3KQV3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
U3KQV3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
U3KQV3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
U3KQV3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
U3KQV3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms