Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N5

SQOR, Sulfide:quinone oxidoreductase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQORQ9Y6N5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SQORQ9Y6N5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SQORQ9Y6N5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SQORQ9Y6N5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SQORQ9Y6N5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SQORQ9Y6N5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SQORQ9Y6N5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SQORQ9Y6N5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SQORQ9Y6N5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SQORQ9Y6N5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SQORQ9Y6N5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SQORQ9Y6N5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SQORQ9Y6N5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SQORQ9Y6N5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SQORQ9Y6N5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SQORQ9Y6N5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SQORQ9Y6N5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SQORQ9Y6N5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SQORQ9Y6N5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SQORQ9Y6N5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SQORQ9Y6N5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SQORQ9Y6N5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SQORQ9Y6N5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SQORQ9Y6N5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SQORQ9Y6N5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SQORQ9Y6N5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SQORQ9Y6N5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SQORQ9Y6N5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SQORQ9Y6N5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SQORQ9Y6N5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SQORQ9Y6N5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SQORQ9Y6N5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SQORQ9Y6N5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SQORQ9Y6N5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SQORQ9Y6N5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SQORQ9Y6N5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SQORQ9Y6N5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SQORQ9Y6N5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SQORQ9Y6N5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SQORQ9Y6N5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SQORQ9Y6N5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SQORQ9Y6N5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SQORQ9Y6N5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SQORQ9Y6N5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SQORQ9Y6N5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SQORQ9Y6N5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SQORQ9Y6N5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SQORQ9Y6N5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SQORQ9Y6N5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SQORQ9Y6N5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SQORQ9Y6N5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SQORQ9Y6N5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SQORQ9Y6N5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SQORQ9Y6N5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SQORQ9Y6N5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SQORQ9Y6N5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SQORQ9Y6N5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SQORQ9Y6N5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SQORQ9Y6N5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SQORQ9Y6N5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SQORQ9Y6N5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SQORQ9Y6N5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SQORQ9Y6N5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SQORQ9Y6N5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SQORQ9Y6N5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SQORQ9Y6N5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SQORQ9Y6N5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SQORQ9Y6N5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SQORQ9Y6N5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SQORQ9Y6N5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SQORQ9Y6N5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SQORQ9Y6N5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SQORQ9Y6N5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SQORQ9Y6N5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SQORQ9Y6N5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SQORQ9Y6N5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SQORQ9Y6N5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SQORQ9Y6N5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SQORQ9Y6N5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SQORQ9Y6N5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SQORQ9Y6N5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SQORQ9Y6N5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SQORQ9Y6N5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SQORQ9Y6N5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SQORQ9Y6N5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SQORQ9Y6N5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SQORQ9Y6N5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SQORQ9Y6N5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SQORQ9Y6N5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SQORQ9Y6N5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SQORQ9Y6N5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SQORQ9Y6N5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SQORQ9Y6N5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SQORQ9Y6N5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SQORQ9Y6N5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SQORQ9Y6N5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SQORQ9Y6N5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SQORQ9Y6N5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SQORQ9Y6N5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SQORQ9Y6N5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms