Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y535

POLR3H, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3HQ9Y535 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR3HQ9Y535 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR3HQ9Y535 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR3HQ9Y535 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR3HQ9Y535 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR3HQ9Y535 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3HQ9Y535 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms