Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y478

PRKAB1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB1Q9Y478 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKAB1Q9Y478 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKAB1Q9Y478 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKAB1Q9Y478 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKAB1Q9Y478 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKAB1Q9Y478 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKAB1Q9Y478 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKAB1Q9Y478 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKAB1Q9Y478 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKAB1Q9Y478 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKAB1Q9Y478 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKAB1Q9Y478 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKAB1Q9Y478 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKAB1Q9Y478 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKAB1Q9Y478 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKAB1Q9Y478 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKAB1Q9Y478 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKAB1Q9Y478 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKAB1Q9Y478 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKAB1Q9Y478 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKAB1Q9Y478 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKAB1Q9Y478 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKAB1Q9Y478 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKAB1Q9Y478 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKAB1Q9Y478 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKAB1Q9Y478 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKAB1Q9Y478 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKAB1Q9Y478 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKAB1Q9Y478 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKAB1Q9Y478 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKAB1Q9Y478 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKAB1Q9Y478 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKAB1Q9Y478 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKAB1Q9Y478 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKAB1Q9Y478 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRKAB1Q9Y478 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRKAB1Q9Y478 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRKAB1Q9Y478 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKAB1Q9Y478 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRKAB1Q9Y478 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms