Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
R3HCC1Q9Y3T6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
R3HCC1Q9Y3T6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
R3HCC1Q9Y3T6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
R3HCC1Q9Y3T6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
R3HCC1Q9Y3T6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
R3HCC1Q9Y3T6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
R3HCC1Q9Y3T6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
R3HCC1Q9Y3T6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
R3HCC1Q9Y3T6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
R3HCC1Q9Y3T6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
R3HCC1Q9Y3T6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
R3HCC1Q9Y3T6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
R3HCC1Q9Y3T6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
R3HCC1Q9Y3T6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
R3HCC1Q9Y3T6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
R3HCC1Q9Y3T6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
R3HCC1Q9Y3T6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
R3HCC1Q9Y3T6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
R3HCC1Q9Y3T6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
R3HCC1Q9Y3T6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
R3HCC1Q9Y3T6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
R3HCC1Q9Y3T6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
R3HCC1Q9Y3T6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
R3HCC1Q9Y3T6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
R3HCC1Q9Y3T6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
R3HCC1Q9Y3T6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
R3HCC1Q9Y3T6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
R3HCC1Q9Y3T6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
R3HCC1Q9Y3T6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
R3HCC1Q9Y3T6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
R3HCC1Q9Y3T6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
R3HCC1Q9Y3T6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
R3HCC1Q9Y3T6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
R3HCC1Q9Y3T6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
R3HCC1Q9Y3T6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
R3HCC1Q9Y3T6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
R3HCC1Q9Y3T6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
R3HCC1Q9Y3T6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
R3HCC1Q9Y3T6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
R3HCC1Q9Y3T6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
R3HCC1Q9Y3T6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
R3HCC1Q9Y3T6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
R3HCC1Q9Y3T6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
R3HCC1Q9Y3T6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
R3HCC1Q9Y3T6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
R3HCC1Q9Y3T6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
R3HCC1Q9Y3T6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
R3HCC1Q9Y3T6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
R3HCC1Q9Y3T6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
R3HCC1Q9Y3T6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
R3HCC1Q9Y3T6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
R3HCC1Q9Y3T6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
R3HCC1Q9Y3T6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
R3HCC1Q9Y3T6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
R3HCC1Q9Y3T6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
R3HCC1Q9Y3T6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
R3HCC1Q9Y3T6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
R3HCC1Q9Y3T6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
R3HCC1Q9Y3T6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
R3HCC1Q9Y3T6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
R3HCC1Q9Y3T6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
R3HCC1Q9Y3T6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
R3HCC1Q9Y3T6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
R3HCC1Q9Y3T6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
R3HCC1Q9Y3T6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
R3HCC1Q9Y3T6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
R3HCC1Q9Y3T6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
R3HCC1Q9Y3T6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
R3HCC1Q9Y3T6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
R3HCC1Q9Y3T6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
R3HCC1Q9Y3T6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
R3HCC1Q9Y3T6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
R3HCC1Q9Y3T6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
R3HCC1Q9Y3T6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
R3HCC1Q9Y3T6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
R3HCC1Q9Y3T6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
R3HCC1Q9Y3T6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
R3HCC1Q9Y3T6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
R3HCC1Q9Y3T6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
R3HCC1Q9Y3T6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
R3HCC1Q9Y3T6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
R3HCC1Q9Y3T6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
R3HCC1Q9Y3T6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
R3HCC1Q9Y3T6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
R3HCC1Q9Y3T6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
R3HCC1Q9Y3T6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
R3HCC1Q9Y3T6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
R3HCC1Q9Y3T6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
R3HCC1Q9Y3T6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
R3HCC1Q9Y3T6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
R3HCC1Q9Y3T6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
R3HCC1Q9Y3T6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
R3HCC1Q9Y3T6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
R3HCC1Q9Y3T6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
R3HCC1Q9Y3T6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
R3HCC1Q9Y3T6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
R3HCC1Q9Y3T6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms