Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRG3Q9Y2Y8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRG3Q9Y2Y8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRG3Q9Y2Y8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRG3Q9Y2Y8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRG3Q9Y2Y8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PRG3Q9Y2Y8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PRG3Q9Y2Y8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRG3Q9Y2Y8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRG3Q9Y2Y8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRG3Q9Y2Y8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRG3Q9Y2Y8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRG3Q9Y2Y8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRG3Q9Y2Y8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRG3Q9Y2Y8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRG3Q9Y2Y8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRG3Q9Y2Y8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRG3Q9Y2Y8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRG3Q9Y2Y8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRG3Q9Y2Y8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRG3Q9Y2Y8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRG3Q9Y2Y8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRG3Q9Y2Y8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRG3Q9Y2Y8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRG3Q9Y2Y8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRG3Q9Y2Y8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRG3Q9Y2Y8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRG3Q9Y2Y8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRG3Q9Y2Y8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRG3Q9Y2Y8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRG3Q9Y2Y8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRG3Q9Y2Y8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRG3Q9Y2Y8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRG3Q9Y2Y8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PRG3Q9Y2Y8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRG3Q9Y2Y8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRG3Q9Y2Y8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRG3Q9Y2Y8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRG3Q9Y2Y8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRG3Q9Y2Y8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRG3Q9Y2Y8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRG3Q9Y2Y8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRG3Q9Y2Y8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRG3Q9Y2Y8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRG3Q9Y2Y8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRG3Q9Y2Y8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PRG3Q9Y2Y8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRG3Q9Y2Y8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRG3Q9Y2Y8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRG3Q9Y2Y8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRG3Q9Y2Y8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRG3Q9Y2Y8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRG3Q9Y2Y8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRG3Q9Y2Y8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRG3Q9Y2Y8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRG3Q9Y2Y8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRG3Q9Y2Y8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRG3Q9Y2Y8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRG3Q9Y2Y8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRG3Q9Y2Y8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRG3Q9Y2Y8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRG3Q9Y2Y8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRG3Q9Y2Y8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRG3Q9Y2Y8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRG3Q9Y2Y8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRG3Q9Y2Y8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PRG3Q9Y2Y8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRG3Q9Y2Y8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRG3Q9Y2Y8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PRG3Q9Y2Y8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRG3Q9Y2Y8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRG3Q9Y2Y8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRG3Q9Y2Y8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRG3Q9Y2Y8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRG3Q9Y2Y8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRG3Q9Y2Y8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRG3Q9Y2Y8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRG3Q9Y2Y8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRG3Q9Y2Y8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRG3Q9Y2Y8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRG3Q9Y2Y8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRG3Q9Y2Y8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRG3Q9Y2Y8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRG3Q9Y2Y8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRG3Q9Y2Y8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PRG3Q9Y2Y8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRG3Q9Y2Y8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PRG3Q9Y2Y8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRG3Q9Y2Y8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRG3Q9Y2Y8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRG3Q9Y2Y8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRG3Q9Y2Y8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PRG3Q9Y2Y8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRG3Q9Y2Y8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRG3Q9Y2Y8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRG3Q9Y2Y8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRG3Q9Y2Y8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRG3Q9Y2Y8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRG3Q9Y2Y8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRG3Q9Y2Y8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms