Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
KDM2AQ9Y2K7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
KDM2AQ9Y2K7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
KDM2AQ9Y2K7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
KDM2AQ9Y2K7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
KDM2AQ9Y2K7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
KDM2AQ9Y2K7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC33.38■■■□□ 2.93
KDM2AQ9Y2K7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
KDM2AQ9Y2K7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
KDM2AQ9Y2K7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
KDM2AQ9Y2K7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
KDM2AQ9Y2K7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
KDM2AQ9Y2K7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
KDM2AQ9Y2K7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
KDM2AQ9Y2K7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
KDM2AQ9Y2K7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
KDM2AQ9Y2K7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
KDM2AQ9Y2K7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
KDM2AQ9Y2K7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
KDM2AQ9Y2K7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
KDM2AQ9Y2K7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
KDM2AQ9Y2K7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
KDM2AQ9Y2K7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
KDM2AQ9Y2K7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
KDM2AQ9Y2K7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
KDM2AQ9Y2K7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
KDM2AQ9Y2K7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
KDM2AQ9Y2K7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
KDM2AQ9Y2K7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
KDM2AQ9Y2K7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
KDM2AQ9Y2K7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
KDM2AQ9Y2K7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
KDM2AQ9Y2K7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
KDM2AQ9Y2K7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
KDM2AQ9Y2K7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
KDM2AQ9Y2K7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
KDM2AQ9Y2K7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
KDM2AQ9Y2K7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
KDM2AQ9Y2K7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
KDM2AQ9Y2K7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
KDM2AQ9Y2K7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
KDM2AQ9Y2K7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
KDM2AQ9Y2K7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
KDM2AQ9Y2K7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
KDM2AQ9Y2K7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
KDM2AQ9Y2K7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
KDM2AQ9Y2K7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
KDM2AQ9Y2K7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
KDM2AQ9Y2K7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
KDM2AQ9Y2K7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
KDM2AQ9Y2K7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
KDM2AQ9Y2K7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
KDM2AQ9Y2K7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
KDM2AQ9Y2K7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
KDM2AQ9Y2K7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
KDM2AQ9Y2K7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
KDM2AQ9Y2K7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
KDM2AQ9Y2K7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
KDM2AQ9Y2K7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
KDM2AQ9Y2K7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
KDM2AQ9Y2K7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
KDM2AQ9Y2K7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
KDM2AQ9Y2K7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
KDM2AQ9Y2K7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
KDM2AQ9Y2K7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
KDM2AQ9Y2K7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
KDM2AQ9Y2K7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
KDM2AQ9Y2K7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
KDM2AQ9Y2K7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
KDM2AQ9Y2K7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
KDM2AQ9Y2K7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
KDM2AQ9Y2K7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
KDM2AQ9Y2K7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
KDM2AQ9Y2K7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
KDM2AQ9Y2K7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
KDM2AQ9Y2K7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
KDM2AQ9Y2K7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
KDM2AQ9Y2K7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
KDM2AQ9Y2K7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
KDM2AQ9Y2K7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
KDM2AQ9Y2K7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
KDM2AQ9Y2K7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
KDM2AQ9Y2K7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
KDM2AQ9Y2K7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
KDM2AQ9Y2K7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
KDM2AQ9Y2K7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
KDM2AQ9Y2K7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
KDM2AQ9Y2K7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
KDM2AQ9Y2K7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
KDM2AQ9Y2K7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
KDM2AQ9Y2K7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
KDM2AQ9Y2K7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
KDM2AQ9Y2K7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
KDM2AQ9Y2K7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
KDM2AQ9Y2K7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
KDM2AQ9Y2K7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
KDM2AQ9Y2K7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
KDM2AQ9Y2K7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
KDM2AQ9Y2K7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
KDM2AQ9Y2K7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms