Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ88

CDK11A, Cyclin-dependent kinase 11A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11AQ9UQ88 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CDK11AQ9UQ88 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CDK11AQ9UQ88 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CDK11AQ9UQ88 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CDK11AQ9UQ88 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
CDK11AQ9UQ88 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
CDK11AQ9UQ88 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CDK11AQ9UQ88 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CDK11AQ9UQ88 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CDK11AQ9UQ88 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
CDK11AQ9UQ88 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CDK11AQ9UQ88 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CDK11AQ9UQ88 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CDK11AQ9UQ88 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CDK11AQ9UQ88 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CDK11AQ9UQ88 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CDK11AQ9UQ88 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CDK11AQ9UQ88 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
CDK11AQ9UQ88 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
CDK11AQ9UQ88 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
CDK11AQ9UQ88 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CDK11AQ9UQ88 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CDK11AQ9UQ88 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CDK11AQ9UQ88 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CDK11AQ9UQ88 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CDK11AQ9UQ88 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CDK11AQ9UQ88 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
CDK11AQ9UQ88 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CDK11AQ9UQ88 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CDK11AQ9UQ88 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CDK11AQ9UQ88 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CDK11AQ9UQ88 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CDK11AQ9UQ88 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CDK11AQ9UQ88 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CDK11AQ9UQ88 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CDK11AQ9UQ88 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CDK11AQ9UQ88 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CDK11AQ9UQ88 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CDK11AQ9UQ88 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CDK11AQ9UQ88 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CDK11AQ9UQ88 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CDK11AQ9UQ88 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CDK11AQ9UQ88 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CDK11AQ9UQ88 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CDK11AQ9UQ88 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CDK11AQ9UQ88 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CDK11AQ9UQ88 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CDK11AQ9UQ88 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CDK11AQ9UQ88 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CDK11AQ9UQ88 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CDK11AQ9UQ88 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CDK11AQ9UQ88 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
CDK11AQ9UQ88 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CDK11AQ9UQ88 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CDK11AQ9UQ88 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CDK11AQ9UQ88 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CDK11AQ9UQ88 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CDK11AQ9UQ88 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CDK11AQ9UQ88 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CDK11AQ9UQ88 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CDK11AQ9UQ88 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CDK11AQ9UQ88 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CDK11AQ9UQ88 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CDK11AQ9UQ88 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CDK11AQ9UQ88 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CDK11AQ9UQ88 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CDK11AQ9UQ88 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CDK11AQ9UQ88 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CDK11AQ9UQ88 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CDK11AQ9UQ88 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CDK11AQ9UQ88 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CDK11AQ9UQ88 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CDK11AQ9UQ88 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CDK11AQ9UQ88 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CDK11AQ9UQ88 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CDK11AQ9UQ88 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CDK11AQ9UQ88 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
CDK11AQ9UQ88 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CDK11AQ9UQ88 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CDK11AQ9UQ88 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CDK11AQ9UQ88 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CDK11AQ9UQ88 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CDK11AQ9UQ88 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CDK11AQ9UQ88 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CDK11AQ9UQ88 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CDK11AQ9UQ88 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CDK11AQ9UQ88 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CDK11AQ9UQ88 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
CDK11AQ9UQ88 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CDK11AQ9UQ88 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CDK11AQ9UQ88 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CDK11AQ9UQ88 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CDK11AQ9UQ88 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CDK11AQ9UQ88 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CDK11AQ9UQ88 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CDK11AQ9UQ88 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
CDK11AQ9UQ88 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CDK11AQ9UQ88 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CDK11AQ9UQ88 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CDK11AQ9UQ88 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms