Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PHF8Q9UPP1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
PHF8Q9UPP1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PHF8Q9UPP1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PHF8Q9UPP1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PHF8Q9UPP1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PHF8Q9UPP1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PHF8Q9UPP1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PHF8Q9UPP1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PHF8Q9UPP1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PHF8Q9UPP1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
PHF8Q9UPP1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PHF8Q9UPP1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
PHF8Q9UPP1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PHF8Q9UPP1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
PHF8Q9UPP1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PHF8Q9UPP1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PHF8Q9UPP1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PHF8Q9UPP1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PHF8Q9UPP1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PHF8Q9UPP1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PHF8Q9UPP1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PHF8Q9UPP1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PHF8Q9UPP1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PHF8Q9UPP1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
PHF8Q9UPP1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PHF8Q9UPP1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PHF8Q9UPP1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
PHF8Q9UPP1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PHF8Q9UPP1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PHF8Q9UPP1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PHF8Q9UPP1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PHF8Q9UPP1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PHF8Q9UPP1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
PHF8Q9UPP1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PHF8Q9UPP1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PHF8Q9UPP1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PHF8Q9UPP1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PHF8Q9UPP1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PHF8Q9UPP1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PHF8Q9UPP1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
PHF8Q9UPP1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PHF8Q9UPP1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PHF8Q9UPP1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PHF8Q9UPP1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PHF8Q9UPP1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PHF8Q9UPP1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PHF8Q9UPP1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PHF8Q9UPP1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PHF8Q9UPP1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PHF8Q9UPP1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PHF8Q9UPP1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PHF8Q9UPP1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PHF8Q9UPP1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PHF8Q9UPP1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PHF8Q9UPP1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PHF8Q9UPP1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PHF8Q9UPP1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PHF8Q9UPP1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
PHF8Q9UPP1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PHF8Q9UPP1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PHF8Q9UPP1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
PHF8Q9UPP1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PHF8Q9UPP1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PHF8Q9UPP1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PHF8Q9UPP1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PHF8Q9UPP1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
PHF8Q9UPP1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
PHF8Q9UPP1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
PHF8Q9UPP1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
PHF8Q9UPP1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PHF8Q9UPP1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
PHF8Q9UPP1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
PHF8Q9UPP1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PHF8Q9UPP1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PHF8Q9UPP1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PHF8Q9UPP1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC32■■■□□ 2.71
PHF8Q9UPP1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PHF8Q9UPP1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PHF8Q9UPP1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PHF8Q9UPP1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
PHF8Q9UPP1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PHF8Q9UPP1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PHF8Q9UPP1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PHF8Q9UPP1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
PHF8Q9UPP1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PHF8Q9UPP1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PHF8Q9UPP1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PHF8Q9UPP1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PHF8Q9UPP1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PHF8Q9UPP1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PHF8Q9UPP1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PHF8Q9UPP1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
PHF8Q9UPP1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PHF8Q9UPP1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PHF8Q9UPP1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PHF8Q9UPP1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PHF8Q9UPP1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PHF8Q9UPP1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PHF8Q9UPP1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms