Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX7Q9UNH6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX7Q9UNH6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX7Q9UNH6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX7Q9UNH6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX7Q9UNH6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX7Q9UNH6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX7Q9UNH6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX7Q9UNH6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX7Q9UNH6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX7Q9UNH6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX7Q9UNH6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX7Q9UNH6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX7Q9UNH6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX7Q9UNH6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX7Q9UNH6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX7Q9UNH6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX7Q9UNH6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX7Q9UNH6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX7Q9UNH6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX7Q9UNH6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX7Q9UNH6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX7Q9UNH6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX7Q9UNH6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX7Q9UNH6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX7Q9UNH6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX7Q9UNH6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX7Q9UNH6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX7Q9UNH6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX7Q9UNH6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX7Q9UNH6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX7Q9UNH6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX7Q9UNH6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX7Q9UNH6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX7Q9UNH6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX7Q9UNH6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX7Q9UNH6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX7Q9UNH6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX7Q9UNH6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX7Q9UNH6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX7Q9UNH6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX7Q9UNH6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX7Q9UNH6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX7Q9UNH6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX7Q9UNH6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX7Q9UNH6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX7Q9UNH6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX7Q9UNH6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX7Q9UNH6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX7Q9UNH6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX7Q9UNH6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX7Q9UNH6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX7Q9UNH6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX7Q9UNH6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX7Q9UNH6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX7Q9UNH6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX7Q9UNH6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX7Q9UNH6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX7Q9UNH6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX7Q9UNH6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX7Q9UNH6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX7Q9UNH6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX7Q9UNH6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX7Q9UNH6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX7Q9UNH6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX7Q9UNH6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX7Q9UNH6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SNX7Q9UNH6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNX7Q9UNH6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNX7Q9UNH6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX7Q9UNH6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX7Q9UNH6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX7Q9UNH6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX7Q9UNH6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX7Q9UNH6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX7Q9UNH6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX7Q9UNH6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX7Q9UNH6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX7Q9UNH6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX7Q9UNH6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX7Q9UNH6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX7Q9UNH6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX7Q9UNH6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX7Q9UNH6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX7Q9UNH6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX7Q9UNH6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX7Q9UNH6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX7Q9UNH6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX7Q9UNH6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX7Q9UNH6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX7Q9UNH6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX7Q9UNH6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX7Q9UNH6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX7Q9UNH6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX7Q9UNH6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX7Q9UNH6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX7Q9UNH6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX7Q9UNH6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX7Q9UNH6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX7Q9UNH6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms