Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM00

TMCO1, Calcium load-activated calcium channel, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO1Q9UM00 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO1Q9UM00 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO1Q9UM00 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO1Q9UM00 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO1Q9UM00 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO1Q9UM00 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO1Q9UM00 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO1Q9UM00 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO1Q9UM00 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO1Q9UM00 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO1Q9UM00 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO1Q9UM00 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO1Q9UM00 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO1Q9UM00 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO1Q9UM00 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO1Q9UM00 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO1Q9UM00 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO1Q9UM00 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO1Q9UM00 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO1Q9UM00 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCO1Q9UM00 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCO1Q9UM00 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCO1Q9UM00 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCO1Q9UM00 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCO1Q9UM00 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCO1Q9UM00 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCO1Q9UM00 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCO1Q9UM00 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCO1Q9UM00 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCO1Q9UM00 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCO1Q9UM00 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCO1Q9UM00 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCO1Q9UM00 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCO1Q9UM00 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO1Q9UM00 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO1Q9UM00 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO1Q9UM00 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO1Q9UM00 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 276.9 ms