Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMCC3Q9ULS5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMCC3Q9ULS5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMCC3Q9ULS5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMCC3Q9ULS5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCC3Q9ULS5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCC3Q9ULS5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCC3Q9ULS5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCC3Q9ULS5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCC3Q9ULS5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCC3Q9ULS5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCC3Q9ULS5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCC3Q9ULS5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCC3Q9ULS5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCC3Q9ULS5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCC3Q9ULS5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCC3Q9ULS5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCC3Q9ULS5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCC3Q9ULS5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMCC3Q9ULS5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMCC3Q9ULS5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMCC3Q9ULS5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMCC3Q9ULS5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TMCC3Q9ULS5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMCC3Q9ULS5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMCC3Q9ULS5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMCC3Q9ULS5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMCC3Q9ULS5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMCC3Q9ULS5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMCC3Q9ULS5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMCC3Q9ULS5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMCC3Q9ULS5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMCC3Q9ULS5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMCC3Q9ULS5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMCC3Q9ULS5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMCC3Q9ULS5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMCC3Q9ULS5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMCC3Q9ULS5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMCC3Q9ULS5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMCC3Q9ULS5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMCC3Q9ULS5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMCC3Q9ULS5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMCC3Q9ULS5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMCC3Q9ULS5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMCC3Q9ULS5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMCC3Q9ULS5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMCC3Q9ULS5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMCC3Q9ULS5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMCC3Q9ULS5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMCC3Q9ULS5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMCC3Q9ULS5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TMCC3Q9ULS5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMCC3Q9ULS5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMCC3Q9ULS5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMCC3Q9ULS5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMCC3Q9ULS5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMCC3Q9ULS5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMCC3Q9ULS5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMCC3Q9ULS5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMCC3Q9ULS5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TMCC3Q9ULS5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMCC3Q9ULS5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMCC3Q9ULS5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMCC3Q9ULS5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMCC3Q9ULS5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMCC3Q9ULS5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMCC3Q9ULS5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMCC3Q9ULS5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMCC3Q9ULS5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMCC3Q9ULS5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms