Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM6

CNOT6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT6Q9ULM6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNOT6Q9ULM6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNOT6Q9ULM6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNOT6Q9ULM6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNOT6Q9ULM6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNOT6Q9ULM6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNOT6Q9ULM6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNOT6Q9ULM6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CNOT6Q9ULM6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNOT6Q9ULM6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNOT6Q9ULM6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CNOT6Q9ULM6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNOT6Q9ULM6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNOT6Q9ULM6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNOT6Q9ULM6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNOT6Q9ULM6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CNOT6Q9ULM6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CNOT6Q9ULM6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNOT6Q9ULM6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNOT6Q9ULM6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNOT6Q9ULM6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNOT6Q9ULM6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNOT6Q9ULM6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNOT6Q9ULM6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNOT6Q9ULM6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNOT6Q9ULM6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNOT6Q9ULM6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNOT6Q9ULM6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNOT6Q9ULM6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNOT6Q9ULM6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNOT6Q9ULM6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNOT6Q9ULM6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CNOT6Q9ULM6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNOT6Q9ULM6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNOT6Q9ULM6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNOT6Q9ULM6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNOT6Q9ULM6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNOT6Q9ULM6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNOT6Q9ULM6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms