Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
ZNF608Q9ULD9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
ZNF608Q9ULD9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
ZNF608Q9ULD9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
ZNF608Q9ULD9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
ZNF608Q9ULD9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
ZNF608Q9ULD9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
ZNF608Q9ULD9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
ZNF608Q9ULD9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
ZNF608Q9ULD9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
ZNF608Q9ULD9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
ZNF608Q9ULD9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
ZNF608Q9ULD9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
ZNF608Q9ULD9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
ZNF608Q9ULD9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
ZNF608Q9ULD9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
ZNF608Q9ULD9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
ZNF608Q9ULD9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
ZNF608Q9ULD9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC39.24■■■■□ 3.87
ZNF608Q9ULD9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
ZNF608Q9ULD9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
ZNF608Q9ULD9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
ZNF608Q9ULD9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC39.23■■■■□ 3.87
ZNF608Q9ULD9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
ZNF608Q9ULD9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC39.23■■■■□ 3.87
ZNF608Q9ULD9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
ZNF608Q9ULD9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
ZNF608Q9ULD9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
ZNF608Q9ULD9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
ZNF608Q9ULD9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
ZNF608Q9ULD9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
ZNF608Q9ULD9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
ZNF608Q9ULD9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
ZNF608Q9ULD9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
ZNF608Q9ULD9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
ZNF608Q9ULD9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
ZNF608Q9ULD9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
ZNF608Q9ULD9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
ZNF608Q9ULD9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
ZNF608Q9ULD9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
ZNF608Q9ULD9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
ZNF608Q9ULD9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC39.19■■■■□ 3.86
ZNF608Q9ULD9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
ZNF608Q9ULD9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC39.19■■■■□ 3.86
ZNF608Q9ULD9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
ZNF608Q9ULD9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
ZNF608Q9ULD9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC39.18■■■■□ 3.86
ZNF608Q9ULD9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
ZNF608Q9ULD9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
ZNF608Q9ULD9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
ZNF608Q9ULD9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC39.17■■■■□ 3.86
ZNF608Q9ULD9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
ZNF608Q9ULD9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
ZNF608Q9ULD9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC39.16■■■■□ 3.86
ZNF608Q9ULD9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
ZNF608Q9ULD9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
ZNF608Q9ULD9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
ZNF608Q9ULD9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
ZNF608Q9ULD9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
ZNF608Q9ULD9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
ZNF608Q9ULD9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
ZNF608Q9ULD9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
ZNF608Q9ULD9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC39.14■■■■□ 3.86
ZNF608Q9ULD9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC39.14■■■■□ 3.86
ZNF608Q9ULD9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
ZNF608Q9ULD9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.86
ZNF608Q9ULD9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.86
ZNF608Q9ULD9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
ZNF608Q9ULD9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
ZNF608Q9ULD9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
ZNF608Q9ULD9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
ZNF608Q9ULD9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
ZNF608Q9ULD9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
ZNF608Q9ULD9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
ZNF608Q9ULD9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
ZNF608Q9ULD9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
ZNF608Q9ULD9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
ZNF608Q9ULD9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
ZNF608Q9ULD9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
ZNF608Q9ULD9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
ZNF608Q9ULD9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
ZNF608Q9ULD9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
ZNF608Q9ULD9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
ZNF608Q9ULD9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC39.09■■■■□ 3.85
ZNF608Q9ULD9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
ZNF608Q9ULD9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
ZNF608Q9ULD9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
ZNF608Q9ULD9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.08■■■■□ 3.85
ZNF608Q9ULD9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
ZNF608Q9ULD9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
ZNF608Q9ULD9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
ZNF608Q9ULD9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.84
ZNF608Q9ULD9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
ZNF608Q9ULD9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
ZNF608Q9ULD9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
ZNF608Q9ULD9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
ZNF608Q9ULD9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
ZNF608Q9ULD9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
ZNF608Q9ULD9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
ZNF608Q9ULD9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms