Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NRXN1Q9ULB1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NRXN1Q9ULB1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
NRXN1Q9ULB1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NRXN1Q9ULB1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
NRXN1Q9ULB1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NRXN1Q9ULB1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NRXN1Q9ULB1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NRXN1Q9ULB1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NRXN1Q9ULB1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NRXN1Q9ULB1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NRXN1Q9ULB1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NRXN1Q9ULB1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NRXN1Q9ULB1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NRXN1Q9ULB1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NRXN1Q9ULB1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NRXN1Q9ULB1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NRXN1Q9ULB1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NRXN1Q9ULB1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NRXN1Q9ULB1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NRXN1Q9ULB1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NRXN1Q9ULB1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NRXN1Q9ULB1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NRXN1Q9ULB1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
NRXN1Q9ULB1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NRXN1Q9ULB1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NRXN1Q9ULB1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
NRXN1Q9ULB1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NRXN1Q9ULB1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NRXN1Q9ULB1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NRXN1Q9ULB1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NRXN1Q9ULB1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NRXN1Q9ULB1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
NRXN1Q9ULB1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NRXN1Q9ULB1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NRXN1Q9ULB1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
NRXN1Q9ULB1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NRXN1Q9ULB1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NRXN1Q9ULB1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NRXN1Q9ULB1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NRXN1Q9ULB1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NRXN1Q9ULB1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NRXN1Q9ULB1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NRXN1Q9ULB1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NRXN1Q9ULB1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NRXN1Q9ULB1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NRXN1Q9ULB1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NRXN1Q9ULB1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NRXN1Q9ULB1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NRXN1Q9ULB1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NRXN1Q9ULB1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NRXN1Q9ULB1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NRXN1Q9ULB1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NRXN1Q9ULB1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NRXN1Q9ULB1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NRXN1Q9ULB1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NRXN1Q9ULB1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NRXN1Q9ULB1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
NRXN1Q9ULB1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
NRXN1Q9ULB1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NRXN1Q9ULB1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
NRXN1Q9ULB1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
NRXN1Q9ULB1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
NRXN1Q9ULB1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
NRXN1Q9ULB1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NRXN1Q9ULB1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
NRXN1Q9ULB1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
NRXN1Q9ULB1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
NRXN1Q9ULB1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NRXN1Q9ULB1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
NRXN1Q9ULB1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NRXN1Q9ULB1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NRXN1Q9ULB1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NRXN1Q9ULB1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NRXN1Q9ULB1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NRXN1Q9ULB1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
NRXN1Q9ULB1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
NRXN1Q9ULB1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NRXN1Q9ULB1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NRXN1Q9ULB1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NRXN1Q9ULB1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NRXN1Q9ULB1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NRXN1Q9ULB1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
NRXN1Q9ULB1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NRXN1Q9ULB1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NRXN1Q9ULB1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NRXN1Q9ULB1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NRXN1Q9ULB1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
NRXN1Q9ULB1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
NRXN1Q9ULB1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NRXN1Q9ULB1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
NRXN1Q9ULB1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NRXN1Q9ULB1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
NRXN1Q9ULB1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NRXN1Q9ULB1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
NRXN1Q9ULB1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
NRXN1Q9ULB1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
NRXN1Q9ULB1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
NRXN1Q9ULB1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
NRXN1Q9ULB1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms