Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL51

HCN2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN2Q9UL51 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HCN2Q9UL51 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HCN2Q9UL51 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HCN2Q9UL51 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HCN2Q9UL51 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HCN2Q9UL51 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HCN2Q9UL51 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HCN2Q9UL51 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HCN2Q9UL51 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HCN2Q9UL51 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HCN2Q9UL51 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HCN2Q9UL51 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HCN2Q9UL51 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HCN2Q9UL51 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HCN2Q9UL51 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HCN2Q9UL51 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HCN2Q9UL51 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HCN2Q9UL51 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HCN2Q9UL51 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HCN2Q9UL51 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HCN2Q9UL51 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HCN2Q9UL51 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HCN2Q9UL51 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HCN2Q9UL51 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HCN2Q9UL51 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HCN2Q9UL51 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HCN2Q9UL51 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HCN2Q9UL51 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HCN2Q9UL51 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HCN2Q9UL51 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HCN2Q9UL51 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HCN2Q9UL51 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HCN2Q9UL51 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HCN2Q9UL51 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HCN2Q9UL51 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HCN2Q9UL51 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HCN2Q9UL51 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HCN2Q9UL51 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HCN2Q9UL51 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HCN2Q9UL51 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HCN2Q9UL51 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HCN2Q9UL51 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HCN2Q9UL51 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HCN2Q9UL51 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HCN2Q9UL51 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HCN2Q9UL51 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HCN2Q9UL51 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HCN2Q9UL51 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HCN2Q9UL51 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HCN2Q9UL51 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HCN2Q9UL51 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HCN2Q9UL51 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HCN2Q9UL51 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HCN2Q9UL51 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HCN2Q9UL51 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HCN2Q9UL51 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HCN2Q9UL51 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HCN2Q9UL51 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HCN2Q9UL51 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HCN2Q9UL51 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HCN2Q9UL51 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HCN2Q9UL51 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HCN2Q9UL51 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HCN2Q9UL51 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HCN2Q9UL51 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HCN2Q9UL51 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HCN2Q9UL51 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HCN2Q9UL51 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HCN2Q9UL51 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HCN2Q9UL51 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HCN2Q9UL51 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HCN2Q9UL51 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HCN2Q9UL51 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HCN2Q9UL51 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HCN2Q9UL51 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HCN2Q9UL51 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HCN2Q9UL51 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HCN2Q9UL51 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HCN2Q9UL51 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HCN2Q9UL51 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HCN2Q9UL51 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HCN2Q9UL51 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HCN2Q9UL51 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HCN2Q9UL51 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HCN2Q9UL51 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HCN2Q9UL51 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HCN2Q9UL51 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HCN2Q9UL51 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HCN2Q9UL51 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HCN2Q9UL51 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HCN2Q9UL51 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HCN2Q9UL51 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HCN2Q9UL51 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HCN2Q9UL51 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HCN2Q9UL51 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HCN2Q9UL51 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HCN2Q9UL51 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HCN2Q9UL51 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HCN2Q9UL51 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HCN2Q9UL51 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms