Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DSEQ9UL01 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DSEQ9UL01 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DSEQ9UL01 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DSEQ9UL01 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DSEQ9UL01 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DSEQ9UL01 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DSEQ9UL01 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DSEQ9UL01 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DSEQ9UL01 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DSEQ9UL01 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
DSEQ9UL01 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DSEQ9UL01 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DSEQ9UL01 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DSEQ9UL01 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DSEQ9UL01 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DSEQ9UL01 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DSEQ9UL01 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DSEQ9UL01 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DSEQ9UL01 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DSEQ9UL01 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DSEQ9UL01 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DSEQ9UL01 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DSEQ9UL01 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DSEQ9UL01 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DSEQ9UL01 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DSEQ9UL01 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DSEQ9UL01 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DSEQ9UL01 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DSEQ9UL01 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DSEQ9UL01 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DSEQ9UL01 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DSEQ9UL01 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DSEQ9UL01 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DSEQ9UL01 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DSEQ9UL01 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DSEQ9UL01 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DSEQ9UL01 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DSEQ9UL01 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DSEQ9UL01 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DSEQ9UL01 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DSEQ9UL01 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DSEQ9UL01 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DSEQ9UL01 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DSEQ9UL01 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DSEQ9UL01 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DSEQ9UL01 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DSEQ9UL01 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DSEQ9UL01 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DSEQ9UL01 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DSEQ9UL01 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
DSEQ9UL01 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DSEQ9UL01 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DSEQ9UL01 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DSEQ9UL01 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DSEQ9UL01 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DSEQ9UL01 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DSEQ9UL01 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DSEQ9UL01 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DSEQ9UL01 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
DSEQ9UL01 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DSEQ9UL01 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DSEQ9UL01 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
DSEQ9UL01 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DSEQ9UL01 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DSEQ9UL01 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DSEQ9UL01 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
DSEQ9UL01 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DSEQ9UL01 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DSEQ9UL01 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DSEQ9UL01 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DSEQ9UL01 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DSEQ9UL01 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DSEQ9UL01 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DSEQ9UL01 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DSEQ9UL01 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DSEQ9UL01 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DSEQ9UL01 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DSEQ9UL01 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DSEQ9UL01 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DSEQ9UL01 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DSEQ9UL01 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DSEQ9UL01 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DSEQ9UL01 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DSEQ9UL01 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DSEQ9UL01 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DSEQ9UL01 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DSEQ9UL01 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DSEQ9UL01 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DSEQ9UL01 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DSEQ9UL01 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DSEQ9UL01 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DSEQ9UL01 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DSEQ9UL01 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DSEQ9UL01 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
DSEQ9UL01 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DSEQ9UL01 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DSEQ9UL01 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
DSEQ9UL01 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DSEQ9UL01 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms