Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKW4

VAV3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, humanhuman

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV3Q9UKW4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VAV3Q9UKW4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
VAV3Q9UKW4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VAV3Q9UKW4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
VAV3Q9UKW4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
VAV3Q9UKW4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
VAV3Q9UKW4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
VAV3Q9UKW4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VAV3Q9UKW4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
VAV3Q9UKW4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VAV3Q9UKW4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VAV3Q9UKW4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VAV3Q9UKW4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VAV3Q9UKW4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VAV3Q9UKW4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VAV3Q9UKW4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VAV3Q9UKW4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VAV3Q9UKW4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
VAV3Q9UKW4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VAV3Q9UKW4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VAV3Q9UKW4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
VAV3Q9UKW4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VAV3Q9UKW4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VAV3Q9UKW4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VAV3Q9UKW4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VAV3Q9UKW4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VAV3Q9UKW4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VAV3Q9UKW4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VAV3Q9UKW4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VAV3Q9UKW4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VAV3Q9UKW4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VAV3Q9UKW4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VAV3Q9UKW4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VAV3Q9UKW4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VAV3Q9UKW4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VAV3Q9UKW4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VAV3Q9UKW4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VAV3Q9UKW4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VAV3Q9UKW4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VAV3Q9UKW4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VAV3Q9UKW4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VAV3Q9UKW4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VAV3Q9UKW4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VAV3Q9UKW4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VAV3Q9UKW4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VAV3Q9UKW4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VAV3Q9UKW4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VAV3Q9UKW4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VAV3Q9UKW4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VAV3Q9UKW4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VAV3Q9UKW4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VAV3Q9UKW4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VAV3Q9UKW4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VAV3Q9UKW4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VAV3Q9UKW4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VAV3Q9UKW4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
VAV3Q9UKW4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VAV3Q9UKW4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VAV3Q9UKW4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VAV3Q9UKW4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VAV3Q9UKW4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
VAV3Q9UKW4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VAV3Q9UKW4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VAV3Q9UKW4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VAV3Q9UKW4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VAV3Q9UKW4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VAV3Q9UKW4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VAV3Q9UKW4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VAV3Q9UKW4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VAV3Q9UKW4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VAV3Q9UKW4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VAV3Q9UKW4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VAV3Q9UKW4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VAV3Q9UKW4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VAV3Q9UKW4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VAV3Q9UKW4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VAV3Q9UKW4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VAV3Q9UKW4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VAV3Q9UKW4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VAV3Q9UKW4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VAV3Q9UKW4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VAV3Q9UKW4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VAV3Q9UKW4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VAV3Q9UKW4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
VAV3Q9UKW4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
VAV3Q9UKW4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
VAV3Q9UKW4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VAV3Q9UKW4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VAV3Q9UKW4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VAV3Q9UKW4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
VAV3Q9UKW4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VAV3Q9UKW4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VAV3Q9UKW4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VAV3Q9UKW4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VAV3Q9UKW4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VAV3Q9UKW4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VAV3Q9UKW4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VAV3Q9UKW4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VAV3Q9UKW4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VAV3Q9UKW4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms