Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PACSIN3Q9UKS6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PACSIN3Q9UKS6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PACSIN3Q9UKS6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PACSIN3Q9UKS6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PACSIN3Q9UKS6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PACSIN3Q9UKS6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PACSIN3Q9UKS6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PACSIN3Q9UKS6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PACSIN3Q9UKS6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PACSIN3Q9UKS6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PACSIN3Q9UKS6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PACSIN3Q9UKS6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3Q9UKS6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3Q9UKS6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3Q9UKS6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3Q9UKS6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3Q9UKS6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3Q9UKS6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3Q9UKS6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3Q9UKS6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3Q9UKS6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3Q9UKS6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3Q9UKS6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3Q9UKS6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3Q9UKS6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3Q9UKS6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3Q9UKS6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3Q9UKS6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3Q9UKS6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3Q9UKS6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3Q9UKS6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3Q9UKS6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3Q9UKS6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3Q9UKS6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3Q9UKS6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3Q9UKS6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3Q9UKS6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3Q9UKS6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3Q9UKS6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3Q9UKS6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3Q9UKS6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3Q9UKS6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms