Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN5

PRDM4, PR domain zinc finger protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4Q9UKN5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM4Q9UKN5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM4Q9UKN5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM4Q9UKN5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM4Q9UKN5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM4Q9UKN5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM4Q9UKN5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM4Q9UKN5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM4Q9UKN5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM4Q9UKN5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM4Q9UKN5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRDM4Q9UKN5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRDM4Q9UKN5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRDM4Q9UKN5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRDM4Q9UKN5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRDM4Q9UKN5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRDM4Q9UKN5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRDM4Q9UKN5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRDM4Q9UKN5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRDM4Q9UKN5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRDM4Q9UKN5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDM4Q9UKN5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDM4Q9UKN5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDM4Q9UKN5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDM4Q9UKN5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDM4Q9UKN5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDM4Q9UKN5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDM4Q9UKN5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDM4Q9UKN5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDM4Q9UKN5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM4Q9UKN5 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM4Q9UKN5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM4Q9UKN5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM4Q9UKN5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM4Q9UKN5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM4Q9UKN5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM4Q9UKN5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDM4Q9UKN5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDM4Q9UKN5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDM4Q9UKN5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDM4Q9UKN5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDM4Q9UKN5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDM4Q9UKN5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM4Q9UKN5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM4Q9UKN5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM4Q9UKN5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM4Q9UKN5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM4Q9UKN5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM4Q9UKN5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM4Q9UKN5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRDM4Q9UKN5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
PRDM4Q9UKN5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRDM4Q9UKN5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRDM4Q9UKN5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRDM4Q9UKN5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRDM4Q9UKN5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRDM4Q9UKN5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRDM4Q9UKN5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRDM4Q9UKN5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRDM4Q9UKN5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRDM4Q9UKN5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRDM4Q9UKN5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRDM4Q9UKN5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRDM4Q9UKN5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PRDM4Q9UKN5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRDM4Q9UKN5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PRDM4Q9UKN5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRDM4Q9UKN5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRDM4Q9UKN5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRDM4Q9UKN5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRDM4Q9UKN5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM4Q9UKN5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM4Q9UKN5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM4Q9UKN5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM4Q9UKN5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM4Q9UKN5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM4Q9UKN5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM4Q9UKN5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM4Q9UKN5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRDM4Q9UKN5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRDM4Q9UKN5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRDM4Q9UKN5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRDM4Q9UKN5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRDM4Q9UKN5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRDM4Q9UKN5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRDM4Q9UKN5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRDM4Q9UKN5 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRDM4Q9UKN5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRDM4Q9UKN5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRDM4Q9UKN5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRDM4Q9UKN5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDM4Q9UKN5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDM4Q9UKN5 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDM4Q9UKN5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDM4Q9UKN5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDM4Q9UKN5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDM4Q9UKN5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDM4Q9UKN5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDM4Q9UKN5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDM4Q9UKN5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms