Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ1

PILRA, Paired immunoglobulin-like type 2 receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PILRAQ9UKJ1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PILRAQ9UKJ1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PILRAQ9UKJ1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PILRAQ9UKJ1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PILRAQ9UKJ1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PILRAQ9UKJ1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PILRAQ9UKJ1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PILRAQ9UKJ1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PILRAQ9UKJ1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PILRAQ9UKJ1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PILRAQ9UKJ1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PILRAQ9UKJ1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PILRAQ9UKJ1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PILRAQ9UKJ1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PILRAQ9UKJ1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PILRAQ9UKJ1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PILRAQ9UKJ1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PILRAQ9UKJ1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PILRAQ9UKJ1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PILRAQ9UKJ1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PILRAQ9UKJ1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PILRAQ9UKJ1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PILRAQ9UKJ1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PILRAQ9UKJ1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PILRAQ9UKJ1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PILRAQ9UKJ1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PILRAQ9UKJ1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PILRAQ9UKJ1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PILRAQ9UKJ1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PILRAQ9UKJ1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PILRAQ9UKJ1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PILRAQ9UKJ1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PILRAQ9UKJ1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PILRAQ9UKJ1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PILRAQ9UKJ1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms