Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRTO4Q9UKD2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRTO4Q9UKD2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRTO4Q9UKD2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MRTO4Q9UKD2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRTO4Q9UKD2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRTO4Q9UKD2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRTO4Q9UKD2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRTO4Q9UKD2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRTO4Q9UKD2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRTO4Q9UKD2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRTO4Q9UKD2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRTO4Q9UKD2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRTO4Q9UKD2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRTO4Q9UKD2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRTO4Q9UKD2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRTO4Q9UKD2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRTO4Q9UKD2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRTO4Q9UKD2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRTO4Q9UKD2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRTO4Q9UKD2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRTO4Q9UKD2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRTO4Q9UKD2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRTO4Q9UKD2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRTO4Q9UKD2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRTO4Q9UKD2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRTO4Q9UKD2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRTO4Q9UKD2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRTO4Q9UKD2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MRTO4Q9UKD2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRTO4Q9UKD2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRTO4Q9UKD2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRTO4Q9UKD2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRTO4Q9UKD2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRTO4Q9UKD2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRTO4Q9UKD2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRTO4Q9UKD2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRTO4Q9UKD2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRTO4Q9UKD2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRTO4Q9UKD2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRTO4Q9UKD2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRTO4Q9UKD2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRTO4Q9UKD2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRTO4Q9UKD2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRTO4Q9UKD2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRTO4Q9UKD2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
MRTO4Q9UKD2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRTO4Q9UKD2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRTO4Q9UKD2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRTO4Q9UKD2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MRTO4Q9UKD2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRTO4Q9UKD2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRTO4Q9UKD2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRTO4Q9UKD2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRTO4Q9UKD2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRTO4Q9UKD2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRTO4Q9UKD2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRTO4Q9UKD2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MRTO4Q9UKD2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRTO4Q9UKD2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRTO4Q9UKD2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MRTO4Q9UKD2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRTO4Q9UKD2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MRTO4Q9UKD2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRTO4Q9UKD2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRTO4Q9UKD2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRTO4Q9UKD2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MRTO4Q9UKD2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRTO4Q9UKD2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRTO4Q9UKD2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRTO4Q9UKD2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRTO4Q9UKD2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRTO4Q9UKD2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRTO4Q9UKD2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRTO4Q9UKD2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRTO4Q9UKD2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRTO4Q9UKD2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRTO4Q9UKD2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRTO4Q9UKD2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRTO4Q9UKD2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRTO4Q9UKD2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRTO4Q9UKD2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRTO4Q9UKD2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRTO4Q9UKD2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRTO4Q9UKD2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRTO4Q9UKD2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MRTO4Q9UKD2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRTO4Q9UKD2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRTO4Q9UKD2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRTO4Q9UKD2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRTO4Q9UKD2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRTO4Q9UKD2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRTO4Q9UKD2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRTO4Q9UKD2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRTO4Q9UKD2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRTO4Q9UKD2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRTO4Q9UKD2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRTO4Q9UKD2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MRTO4Q9UKD2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
MRTO4Q9UKD2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms