Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW3

DNMT3L, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3LQ9UJW3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNMT3LQ9UJW3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNMT3LQ9UJW3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNMT3LQ9UJW3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNMT3LQ9UJW3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNMT3LQ9UJW3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNMT3LQ9UJW3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNMT3LQ9UJW3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNMT3LQ9UJW3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNMT3LQ9UJW3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DNMT3LQ9UJW3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNMT3LQ9UJW3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNMT3LQ9UJW3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNMT3LQ9UJW3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNMT3LQ9UJW3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNMT3LQ9UJW3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNMT3LQ9UJW3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNMT3LQ9UJW3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNMT3LQ9UJW3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DNMT3LQ9UJW3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DNMT3LQ9UJW3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DNMT3LQ9UJW3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNMT3LQ9UJW3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNMT3LQ9UJW3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNMT3LQ9UJW3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNMT3LQ9UJW3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNMT3LQ9UJW3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNMT3LQ9UJW3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNMT3LQ9UJW3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNMT3LQ9UJW3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNMT3LQ9UJW3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DNMT3LQ9UJW3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DNMT3LQ9UJW3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DNMT3LQ9UJW3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DNMT3LQ9UJW3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNMT3LQ9UJW3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNMT3LQ9UJW3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNMT3LQ9UJW3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNMT3LQ9UJW3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNMT3LQ9UJW3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNMT3LQ9UJW3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNMT3LQ9UJW3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNMT3LQ9UJW3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNMT3LQ9UJW3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNMT3LQ9UJW3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNMT3LQ9UJW3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNMT3LQ9UJW3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNMT3LQ9UJW3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNMT3LQ9UJW3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNMT3LQ9UJW3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNMT3LQ9UJW3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNMT3LQ9UJW3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNMT3LQ9UJW3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNMT3LQ9UJW3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNMT3LQ9UJW3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNMT3LQ9UJW3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNMT3LQ9UJW3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNMT3LQ9UJW3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNMT3LQ9UJW3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNMT3LQ9UJW3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNMT3LQ9UJW3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNMT3LQ9UJW3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DNMT3LQ9UJW3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNMT3LQ9UJW3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNMT3LQ9UJW3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DNMT3LQ9UJW3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNMT3LQ9UJW3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNMT3LQ9UJW3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DNMT3LQ9UJW3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNMT3LQ9UJW3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNMT3LQ9UJW3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNMT3LQ9UJW3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNMT3LQ9UJW3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DNMT3LQ9UJW3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNMT3LQ9UJW3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNMT3LQ9UJW3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNMT3LQ9UJW3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNMT3LQ9UJW3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNMT3LQ9UJW3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNMT3LQ9UJW3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNMT3LQ9UJW3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNMT3LQ9UJW3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms