Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SALL4Q9UJQ4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SALL4Q9UJQ4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SALL4Q9UJQ4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SALL4Q9UJQ4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SALL4Q9UJQ4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SALL4Q9UJQ4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SALL4Q9UJQ4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SALL4Q9UJQ4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SALL4Q9UJQ4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SALL4Q9UJQ4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SALL4Q9UJQ4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SALL4Q9UJQ4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SALL4Q9UJQ4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SALL4Q9UJQ4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SALL4Q9UJQ4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SALL4Q9UJQ4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SALL4Q9UJQ4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SALL4Q9UJQ4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SALL4Q9UJQ4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SALL4Q9UJQ4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SALL4Q9UJQ4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SALL4Q9UJQ4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SALL4Q9UJQ4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SALL4Q9UJQ4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SALL4Q9UJQ4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SALL4Q9UJQ4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SALL4Q9UJQ4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SALL4Q9UJQ4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SALL4Q9UJQ4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SALL4Q9UJQ4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SALL4Q9UJQ4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SALL4Q9UJQ4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SALL4Q9UJQ4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SALL4Q9UJQ4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SALL4Q9UJQ4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SALL4Q9UJQ4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SALL4Q9UJQ4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SALL4Q9UJQ4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SALL4Q9UJQ4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SALL4Q9UJQ4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SALL4Q9UJQ4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SALL4Q9UJQ4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SALL4Q9UJQ4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SALL4Q9UJQ4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SALL4Q9UJQ4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SALL4Q9UJQ4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SALL4Q9UJQ4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SALL4Q9UJQ4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SALL4Q9UJQ4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SALL4Q9UJQ4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SALL4Q9UJQ4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SALL4Q9UJQ4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SALL4Q9UJQ4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SALL4Q9UJQ4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SALL4Q9UJQ4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SALL4Q9UJQ4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SALL4Q9UJQ4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SALL4Q9UJQ4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SALL4Q9UJQ4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SALL4Q9UJQ4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SALL4Q9UJQ4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SALL4Q9UJQ4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SALL4Q9UJQ4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SALL4Q9UJQ4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SALL4Q9UJQ4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SALL4Q9UJQ4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SALL4Q9UJQ4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SALL4Q9UJQ4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SALL4Q9UJQ4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SALL4Q9UJQ4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SALL4Q9UJQ4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SALL4Q9UJQ4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SALL4Q9UJQ4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SALL4Q9UJQ4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SALL4Q9UJQ4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SALL4Q9UJQ4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SALL4Q9UJQ4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SALL4Q9UJQ4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SALL4Q9UJQ4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SALL4Q9UJQ4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SALL4Q9UJQ4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SALL4Q9UJQ4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SALL4Q9UJQ4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SALL4Q9UJQ4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SALL4Q9UJQ4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SALL4Q9UJQ4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SALL4Q9UJQ4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SALL4Q9UJQ4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SALL4Q9UJQ4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SALL4Q9UJQ4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SALL4Q9UJQ4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SALL4Q9UJQ4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SALL4Q9UJQ4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SALL4Q9UJQ4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SALL4Q9UJQ4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SALL4Q9UJQ4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SALL4Q9UJQ4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SALL4Q9UJQ4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SALL4Q9UJQ4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms