Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJK0

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR3Q9UJK0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSR3Q9UJK0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSR3Q9UJK0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSR3Q9UJK0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSR3Q9UJK0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSR3Q9UJK0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TSR3Q9UJK0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSR3Q9UJK0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSR3Q9UJK0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSR3Q9UJK0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSR3Q9UJK0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSR3Q9UJK0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSR3Q9UJK0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSR3Q9UJK0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSR3Q9UJK0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSR3Q9UJK0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSR3Q9UJK0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSR3Q9UJK0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSR3Q9UJK0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSR3Q9UJK0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSR3Q9UJK0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSR3Q9UJK0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSR3Q9UJK0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSR3Q9UJK0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSR3Q9UJK0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSR3Q9UJK0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSR3Q9UJK0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSR3Q9UJK0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSR3Q9UJK0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSR3Q9UJK0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSR3Q9UJK0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSR3Q9UJK0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSR3Q9UJK0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSR3Q9UJK0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSR3Q9UJK0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSR3Q9UJK0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSR3Q9UJK0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSR3Q9UJK0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSR3Q9UJK0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSR3Q9UJK0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSR3Q9UJK0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSR3Q9UJK0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSR3Q9UJK0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSR3Q9UJK0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSR3Q9UJK0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSR3Q9UJK0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSR3Q9UJK0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSR3Q9UJK0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSR3Q9UJK0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSR3Q9UJK0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSR3Q9UJK0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSR3Q9UJK0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSR3Q9UJK0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TSR3Q9UJK0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSR3Q9UJK0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSR3Q9UJK0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSR3Q9UJK0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSR3Q9UJK0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSR3Q9UJK0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSR3Q9UJK0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSR3Q9UJK0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSR3Q9UJK0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSR3Q9UJK0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSR3Q9UJK0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSR3Q9UJK0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSR3Q9UJK0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSR3Q9UJK0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSR3Q9UJK0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSR3Q9UJK0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSR3Q9UJK0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSR3Q9UJK0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSR3Q9UJK0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSR3Q9UJK0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSR3Q9UJK0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSR3Q9UJK0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSR3Q9UJK0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSR3Q9UJK0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSR3Q9UJK0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSR3Q9UJK0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSR3Q9UJK0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSR3Q9UJK0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSR3Q9UJK0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSR3Q9UJK0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSR3Q9UJK0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TSR3Q9UJK0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSR3Q9UJK0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSR3Q9UJK0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSR3Q9UJK0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSR3Q9UJK0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSR3Q9UJK0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSR3Q9UJK0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TSR3Q9UJK0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSR3Q9UJK0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSR3Q9UJK0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSR3Q9UJK0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSR3Q9UJK0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSR3Q9UJK0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TSR3Q9UJK0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSR3Q9UJK0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSR3Q9UJK0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms