Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII4

HERC5, E3 ISG15--protein ligase HERC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC5Q9UII4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HERC5Q9UII4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HERC5Q9UII4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HERC5Q9UII4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HERC5Q9UII4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HERC5Q9UII4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HERC5Q9UII4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HERC5Q9UII4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HERC5Q9UII4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HERC5Q9UII4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HERC5Q9UII4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HERC5Q9UII4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HERC5Q9UII4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HERC5Q9UII4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
HERC5Q9UII4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
HERC5Q9UII4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HERC5Q9UII4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HERC5Q9UII4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HERC5Q9UII4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HERC5Q9UII4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HERC5Q9UII4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
HERC5Q9UII4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HERC5Q9UII4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HERC5Q9UII4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HERC5Q9UII4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HERC5Q9UII4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HERC5Q9UII4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HERC5Q9UII4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HERC5Q9UII4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HERC5Q9UII4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HERC5Q9UII4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HERC5Q9UII4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
HERC5Q9UII4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HERC5Q9UII4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HERC5Q9UII4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HERC5Q9UII4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HERC5Q9UII4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HERC5Q9UII4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
HERC5Q9UII4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HERC5Q9UII4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HERC5Q9UII4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
HERC5Q9UII4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HERC5Q9UII4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HERC5Q9UII4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
HERC5Q9UII4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
HERC5Q9UII4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HERC5Q9UII4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HERC5Q9UII4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HERC5Q9UII4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HERC5Q9UII4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HERC5Q9UII4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HERC5Q9UII4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HERC5Q9UII4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HERC5Q9UII4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HERC5Q9UII4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HERC5Q9UII4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HERC5Q9UII4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HERC5Q9UII4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HERC5Q9UII4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HERC5Q9UII4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HERC5Q9UII4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HERC5Q9UII4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HERC5Q9UII4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HERC5Q9UII4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HERC5Q9UII4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HERC5Q9UII4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HERC5Q9UII4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HERC5Q9UII4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HERC5Q9UII4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HERC5Q9UII4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HERC5Q9UII4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
HERC5Q9UII4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
HERC5Q9UII4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HERC5Q9UII4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HERC5Q9UII4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HERC5Q9UII4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HERC5Q9UII4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HERC5Q9UII4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HERC5Q9UII4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HERC5Q9UII4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HERC5Q9UII4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HERC5Q9UII4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
HERC5Q9UII4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
HERC5Q9UII4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HERC5Q9UII4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HERC5Q9UII4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HERC5Q9UII4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
HERC5Q9UII4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HERC5Q9UII4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HERC5Q9UII4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HERC5Q9UII4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HERC5Q9UII4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HERC5Q9UII4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HERC5Q9UII4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HERC5Q9UII4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HERC5Q9UII4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HERC5Q9UII4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HERC5Q9UII4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HERC5Q9UII4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HERC5Q9UII4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms