Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFMBT1Q9UHJ3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFMBT1Q9UHJ3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFMBT1Q9UHJ3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFMBT1Q9UHJ3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFMBT1Q9UHJ3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFMBT1Q9UHJ3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFMBT1Q9UHJ3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFMBT1Q9UHJ3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFMBT1Q9UHJ3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFMBT1Q9UHJ3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFMBT1Q9UHJ3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFMBT1Q9UHJ3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFMBT1Q9UHJ3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFMBT1Q9UHJ3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFMBT1Q9UHJ3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFMBT1Q9UHJ3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFMBT1Q9UHJ3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFMBT1Q9UHJ3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFMBT1Q9UHJ3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFMBT1Q9UHJ3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFMBT1Q9UHJ3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFMBT1Q9UHJ3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFMBT1Q9UHJ3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFMBT1Q9UHJ3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFMBT1Q9UHJ3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFMBT1Q9UHJ3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFMBT1Q9UHJ3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFMBT1Q9UHJ3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFMBT1Q9UHJ3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFMBT1Q9UHJ3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFMBT1Q9UHJ3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFMBT1Q9UHJ3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFMBT1Q9UHJ3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFMBT1Q9UHJ3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFMBT1Q9UHJ3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFMBT1Q9UHJ3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFMBT1Q9UHJ3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SFMBT1Q9UHJ3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFMBT1Q9UHJ3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFMBT1Q9UHJ3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFMBT1Q9UHJ3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFMBT1Q9UHJ3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFMBT1Q9UHJ3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFMBT1Q9UHJ3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFMBT1Q9UHJ3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFMBT1Q9UHJ3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFMBT1Q9UHJ3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFMBT1Q9UHJ3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFMBT1Q9UHJ3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFMBT1Q9UHJ3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFMBT1Q9UHJ3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFMBT1Q9UHJ3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFMBT1Q9UHJ3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SFMBT1Q9UHJ3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SFMBT1Q9UHJ3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFMBT1Q9UHJ3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFMBT1Q9UHJ3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SFMBT1Q9UHJ3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SFMBT1Q9UHJ3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SFMBT1Q9UHJ3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFMBT1Q9UHJ3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFMBT1Q9UHJ3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFMBT1Q9UHJ3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFMBT1Q9UHJ3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFMBT1Q9UHJ3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SFMBT1Q9UHJ3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFMBT1Q9UHJ3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFMBT1Q9UHJ3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFMBT1Q9UHJ3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFMBT1Q9UHJ3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SFMBT1Q9UHJ3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFMBT1Q9UHJ3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFMBT1Q9UHJ3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFMBT1Q9UHJ3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFMBT1Q9UHJ3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFMBT1Q9UHJ3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFMBT1Q9UHJ3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFMBT1Q9UHJ3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFMBT1Q9UHJ3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFMBT1Q9UHJ3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFMBT1Q9UHJ3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFMBT1Q9UHJ3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFMBT1Q9UHJ3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFMBT1Q9UHJ3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFMBT1Q9UHJ3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFMBT1Q9UHJ3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFMBT1Q9UHJ3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFMBT1Q9UHJ3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFMBT1Q9UHJ3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SFMBT1Q9UHJ3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SFMBT1Q9UHJ3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SFMBT1Q9UHJ3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms