Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VTI1BQ9UEU0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VTI1BQ9UEU0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VTI1BQ9UEU0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VTI1BQ9UEU0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VTI1BQ9UEU0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VTI1BQ9UEU0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VTI1BQ9UEU0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTI1BQ9UEU0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTI1BQ9UEU0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTI1BQ9UEU0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTI1BQ9UEU0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTI1BQ9UEU0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTI1BQ9UEU0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTI1BQ9UEU0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTI1BQ9UEU0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTI1BQ9UEU0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTI1BQ9UEU0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTI1BQ9UEU0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTI1BQ9UEU0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTI1BQ9UEU0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTI1BQ9UEU0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTI1BQ9UEU0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VTI1BQ9UEU0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTI1BQ9UEU0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTI1BQ9UEU0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTI1BQ9UEU0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTI1BQ9UEU0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTI1BQ9UEU0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTI1BQ9UEU0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTI1BQ9UEU0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTI1BQ9UEU0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTI1BQ9UEU0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTI1BQ9UEU0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTI1BQ9UEU0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTI1BQ9UEU0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VTI1BQ9UEU0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VTI1BQ9UEU0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VTI1BQ9UEU0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VTI1BQ9UEU0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VTI1BQ9UEU0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VTI1BQ9UEU0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VTI1BQ9UEU0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VTI1BQ9UEU0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VTI1BQ9UEU0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VTI1BQ9UEU0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTI1BQ9UEU0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTI1BQ9UEU0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTI1BQ9UEU0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTI1BQ9UEU0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
VTI1BQ9UEU0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VTI1BQ9UEU0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VTI1BQ9UEU0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VTI1BQ9UEU0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VTI1BQ9UEU0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VTI1BQ9UEU0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VTI1BQ9UEU0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VTI1BQ9UEU0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTI1BQ9UEU0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTI1BQ9UEU0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTI1BQ9UEU0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTI1BQ9UEU0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTI1BQ9UEU0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VTI1BQ9UEU0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTI1BQ9UEU0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTI1BQ9UEU0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTI1BQ9UEU0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTI1BQ9UEU0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VTI1BQ9UEU0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VTI1BQ9UEU0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VTI1BQ9UEU0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VTI1BQ9UEU0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VTI1BQ9UEU0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VTI1BQ9UEU0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VTI1BQ9UEU0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VTI1BQ9UEU0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VTI1BQ9UEU0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VTI1BQ9UEU0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VTI1BQ9UEU0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VTI1BQ9UEU0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VTI1BQ9UEU0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VTI1BQ9UEU0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
VTI1BQ9UEU0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VTI1BQ9UEU0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VTI1BQ9UEU0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
VTI1BQ9UEU0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VTI1BQ9UEU0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VTI1BQ9UEU0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VTI1BQ9UEU0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VTI1BQ9UEU0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VTI1BQ9UEU0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VTI1BQ9UEU0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VTI1BQ9UEU0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VTI1BQ9UEU0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VTI1BQ9UEU0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VTI1BQ9UEU0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VTI1BQ9UEU0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VTI1BQ9UEU0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VTI1BQ9UEU0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VTI1BQ9UEU0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms