Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CFDP1Q9UEE9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CFDP1Q9UEE9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CFDP1Q9UEE9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CFDP1Q9UEE9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CFDP1Q9UEE9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CFDP1Q9UEE9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
CFDP1Q9UEE9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CFDP1Q9UEE9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CFDP1Q9UEE9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CFDP1Q9UEE9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CFDP1Q9UEE9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CFDP1Q9UEE9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CFDP1Q9UEE9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CFDP1Q9UEE9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CFDP1Q9UEE9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CFDP1Q9UEE9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CFDP1Q9UEE9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CFDP1Q9UEE9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CFDP1Q9UEE9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CFDP1Q9UEE9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CFDP1Q9UEE9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CFDP1Q9UEE9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CFDP1Q9UEE9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CFDP1Q9UEE9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CFDP1Q9UEE9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CFDP1Q9UEE9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CFDP1Q9UEE9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CFDP1Q9UEE9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CFDP1Q9UEE9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CFDP1Q9UEE9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CFDP1Q9UEE9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CFDP1Q9UEE9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CFDP1Q9UEE9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
CFDP1Q9UEE9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CFDP1Q9UEE9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CFDP1Q9UEE9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CFDP1Q9UEE9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CFDP1Q9UEE9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CFDP1Q9UEE9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CFDP1Q9UEE9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CFDP1Q9UEE9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CFDP1Q9UEE9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CFDP1Q9UEE9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CFDP1Q9UEE9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CFDP1Q9UEE9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CFDP1Q9UEE9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CFDP1Q9UEE9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CFDP1Q9UEE9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
CFDP1Q9UEE9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
CFDP1Q9UEE9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
CFDP1Q9UEE9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
CFDP1Q9UEE9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
CFDP1Q9UEE9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
CFDP1Q9UEE9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
CFDP1Q9UEE9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CFDP1Q9UEE9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CFDP1Q9UEE9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CFDP1Q9UEE9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
CFDP1Q9UEE9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CFDP1Q9UEE9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
CFDP1Q9UEE9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CFDP1Q9UEE9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CFDP1Q9UEE9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CFDP1Q9UEE9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CFDP1Q9UEE9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CFDP1Q9UEE9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CFDP1Q9UEE9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CFDP1Q9UEE9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CFDP1Q9UEE9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CFDP1Q9UEE9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CFDP1Q9UEE9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CFDP1Q9UEE9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CFDP1Q9UEE9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CFDP1Q9UEE9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CFDP1Q9UEE9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
CFDP1Q9UEE9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CFDP1Q9UEE9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CFDP1Q9UEE9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CFDP1Q9UEE9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
CFDP1Q9UEE9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CFDP1Q9UEE9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CFDP1Q9UEE9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CFDP1Q9UEE9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CFDP1Q9UEE9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
CFDP1Q9UEE9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CFDP1Q9UEE9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
CFDP1Q9UEE9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
CFDP1Q9UEE9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
CFDP1Q9UEE9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
CFDP1Q9UEE9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CFDP1Q9UEE9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CFDP1Q9UEE9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CFDP1Q9UEE9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CFDP1Q9UEE9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CFDP1Q9UEE9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CFDP1Q9UEE9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CFDP1Q9UEE9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CFDP1Q9UEE9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CFDP1Q9UEE9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.8 ms