Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NXF1Q9UBU9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NXF1Q9UBU9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NXF1Q9UBU9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NXF1Q9UBU9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NXF1Q9UBU9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NXF1Q9UBU9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NXF1Q9UBU9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NXF1Q9UBU9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NXF1Q9UBU9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NXF1Q9UBU9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NXF1Q9UBU9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NXF1Q9UBU9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NXF1Q9UBU9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NXF1Q9UBU9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NXF1Q9UBU9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NXF1Q9UBU9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NXF1Q9UBU9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NXF1Q9UBU9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NXF1Q9UBU9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NXF1Q9UBU9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NXF1Q9UBU9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NXF1Q9UBU9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NXF1Q9UBU9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NXF1Q9UBU9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NXF1Q9UBU9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NXF1Q9UBU9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NXF1Q9UBU9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NXF1Q9UBU9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NXF1Q9UBU9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NXF1Q9UBU9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NXF1Q9UBU9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NXF1Q9UBU9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NXF1Q9UBU9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NXF1Q9UBU9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NXF1Q9UBU9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NXF1Q9UBU9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NXF1Q9UBU9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NXF1Q9UBU9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NXF1Q9UBU9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NXF1Q9UBU9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NXF1Q9UBU9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NXF1Q9UBU9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NXF1Q9UBU9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NXF1Q9UBU9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NXF1Q9UBU9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NXF1Q9UBU9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NXF1Q9UBU9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NXF1Q9UBU9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NXF1Q9UBU9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NXF1Q9UBU9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NXF1Q9UBU9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NXF1Q9UBU9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NXF1Q9UBU9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NXF1Q9UBU9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NXF1Q9UBU9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NXF1Q9UBU9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NXF1Q9UBU9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NXF1Q9UBU9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NXF1Q9UBU9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NXF1Q9UBU9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NXF1Q9UBU9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NXF1Q9UBU9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NXF1Q9UBU9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NXF1Q9UBU9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NXF1Q9UBU9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NXF1Q9UBU9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NXF1Q9UBU9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NXF1Q9UBU9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NXF1Q9UBU9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NXF1Q9UBU9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NXF1Q9UBU9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NXF1Q9UBU9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NXF1Q9UBU9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NXF1Q9UBU9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NXF1Q9UBU9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NXF1Q9UBU9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NXF1Q9UBU9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NXF1Q9UBU9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NXF1Q9UBU9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NXF1Q9UBU9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NXF1Q9UBU9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NXF1Q9UBU9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NXF1Q9UBU9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NXF1Q9UBU9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NXF1Q9UBU9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NXF1Q9UBU9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NXF1Q9UBU9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NXF1Q9UBU9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NXF1Q9UBU9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NXF1Q9UBU9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NXF1Q9UBU9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NXF1Q9UBU9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NXF1Q9UBU9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NXF1Q9UBU9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NXF1Q9UBU9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NXF1Q9UBU9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NXF1Q9UBU9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NXF1Q9UBU9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NXF1Q9UBU9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms