Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
HDAC6Q9UBN7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
HDAC6Q9UBN7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
HDAC6Q9UBN7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
HDAC6Q9UBN7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
HDAC6Q9UBN7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDAC6Q9UBN7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HDAC6Q9UBN7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HDAC6Q9UBN7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDAC6Q9UBN7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
HDAC6Q9UBN7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDAC6Q9UBN7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDAC6Q9UBN7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
HDAC6Q9UBN7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDAC6Q9UBN7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDAC6Q9UBN7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
HDAC6Q9UBN7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDAC6Q9UBN7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDAC6Q9UBN7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDAC6Q9UBN7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDAC6Q9UBN7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDAC6Q9UBN7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDAC6Q9UBN7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDAC6Q9UBN7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDAC6Q9UBN7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDAC6Q9UBN7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDAC6Q9UBN7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDAC6Q9UBN7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDAC6Q9UBN7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDAC6Q9UBN7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
HDAC6Q9UBN7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDAC6Q9UBN7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDAC6Q9UBN7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDAC6Q9UBN7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HDAC6Q9UBN7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HDAC6Q9UBN7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HDAC6Q9UBN7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HDAC6Q9UBN7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
HDAC6Q9UBN7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HDAC6Q9UBN7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HDAC6Q9UBN7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HDAC6Q9UBN7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HDAC6Q9UBN7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HDAC6Q9UBN7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HDAC6Q9UBN7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HDAC6Q9UBN7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
HDAC6Q9UBN7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HDAC6Q9UBN7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HDAC6Q9UBN7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HDAC6Q9UBN7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HDAC6Q9UBN7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HDAC6Q9UBN7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HDAC6Q9UBN7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HDAC6Q9UBN7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HDAC6Q9UBN7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HDAC6Q9UBN7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HDAC6Q9UBN7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HDAC6Q9UBN7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HDAC6Q9UBN7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
HDAC6Q9UBN7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HDAC6Q9UBN7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HDAC6Q9UBN7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HDAC6Q9UBN7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
HDAC6Q9UBN7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HDAC6Q9UBN7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HDAC6Q9UBN7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HDAC6Q9UBN7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HDAC6Q9UBN7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HDAC6Q9UBN7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HDAC6Q9UBN7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HDAC6Q9UBN7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HDAC6Q9UBN7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HDAC6Q9UBN7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HDAC6Q9UBN7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HDAC6Q9UBN7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HDAC6Q9UBN7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDAC6Q9UBN7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDAC6Q9UBN7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDAC6Q9UBN7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDAC6Q9UBN7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDAC6Q9UBN7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDAC6Q9UBN7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDAC6Q9UBN7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDAC6Q9UBN7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDAC6Q9UBN7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDAC6Q9UBN7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDAC6Q9UBN7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDAC6Q9UBN7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDAC6Q9UBN7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDAC6Q9UBN7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HDAC6Q9UBN7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
HDAC6Q9UBN7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HDAC6Q9UBN7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HDAC6Q9UBN7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HDAC6Q9UBN7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HDAC6Q9UBN7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HDAC6Q9UBN7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HDAC6Q9UBN7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDAC6Q9UBN7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDAC6Q9UBN7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms