Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNMT3BQ9UBC3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNMT3BQ9UBC3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNMT3BQ9UBC3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNMT3BQ9UBC3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DNMT3BQ9UBC3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNMT3BQ9UBC3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNMT3BQ9UBC3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNMT3BQ9UBC3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNMT3BQ9UBC3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNMT3BQ9UBC3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNMT3BQ9UBC3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNMT3BQ9UBC3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNMT3BQ9UBC3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNMT3BQ9UBC3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNMT3BQ9UBC3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNMT3BQ9UBC3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNMT3BQ9UBC3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNMT3BQ9UBC3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNMT3BQ9UBC3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNMT3BQ9UBC3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNMT3BQ9UBC3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNMT3BQ9UBC3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DNMT3BQ9UBC3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNMT3BQ9UBC3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNMT3BQ9UBC3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNMT3BQ9UBC3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DNMT3BQ9UBC3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNMT3BQ9UBC3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNMT3BQ9UBC3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNMT3BQ9UBC3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNMT3BQ9UBC3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNMT3BQ9UBC3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNMT3BQ9UBC3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNMT3BQ9UBC3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNMT3BQ9UBC3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNMT3BQ9UBC3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
DNMT3BQ9UBC3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNMT3BQ9UBC3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNMT3BQ9UBC3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNMT3BQ9UBC3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DNMT3BQ9UBC3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNMT3BQ9UBC3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNMT3BQ9UBC3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNMT3BQ9UBC3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNMT3BQ9UBC3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNMT3BQ9UBC3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNMT3BQ9UBC3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNMT3BQ9UBC3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNMT3BQ9UBC3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNMT3BQ9UBC3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNMT3BQ9UBC3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNMT3BQ9UBC3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNMT3BQ9UBC3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNMT3BQ9UBC3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DNMT3BQ9UBC3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNMT3BQ9UBC3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNMT3BQ9UBC3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNMT3BQ9UBC3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNMT3BQ9UBC3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNMT3BQ9UBC3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNMT3BQ9UBC3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DNMT3BQ9UBC3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNMT3BQ9UBC3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNMT3BQ9UBC3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNMT3BQ9UBC3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNMT3BQ9UBC3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNMT3BQ9UBC3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNMT3BQ9UBC3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
DNMT3BQ9UBC3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNMT3BQ9UBC3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
DNMT3BQ9UBC3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNMT3BQ9UBC3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNMT3BQ9UBC3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNMT3BQ9UBC3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNMT3BQ9UBC3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNMT3BQ9UBC3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNMT3BQ9UBC3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNMT3BQ9UBC3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNMT3BQ9UBC3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNMT3BQ9UBC3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DNMT3BQ9UBC3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNMT3BQ9UBC3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNMT3BQ9UBC3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNMT3BQ9UBC3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNMT3BQ9UBC3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNMT3BQ9UBC3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNMT3BQ9UBC3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNMT3BQ9UBC3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNMT3BQ9UBC3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNMT3BQ9UBC3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNMT3BQ9UBC3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNMT3BQ9UBC3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
DNMT3BQ9UBC3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
DNMT3BQ9UBC3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
DNMT3BQ9UBC3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNMT3BQ9UBC3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNMT3BQ9UBC3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNMT3BQ9UBC3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DNMT3BQ9UBC3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms