Protein–RNA interactions for Protein: Q9P253

VPS18, Vacuolar protein sorting-associated protein 18 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS18Q9P253 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS18Q9P253 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS18Q9P253 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS18Q9P253 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS18Q9P253 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS18Q9P253 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS18Q9P253 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS18Q9P253 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS18Q9P253 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS18Q9P253 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS18Q9P253 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS18Q9P253 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS18Q9P253 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS18Q9P253 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS18Q9P253 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS18Q9P253 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS18Q9P253 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS18Q9P253 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS18Q9P253 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS18Q9P253 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS18Q9P253 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS18Q9P253 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS18Q9P253 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS18Q9P253 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS18Q9P253 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS18Q9P253 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS18Q9P253 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS18Q9P253 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS18Q9P253 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS18Q9P253 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS18Q9P253 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS18Q9P253 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS18Q9P253 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS18Q9P253 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS18Q9P253 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS18Q9P253 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VPS18Q9P253 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VPS18Q9P253 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VPS18Q9P253 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms